Иногда не получается установить сертификат в контейнер КриптоПро CSP в автоматическом режиме.
В этом случае необходимо это сделать в ручном режиме.
Запуск программы "Инструменты КриптоПро" (cptools)
Запустите программу: ПУСК > КРИПТО-ПРО > Инструменты КриптоПро
или воспользуйтесь поиском через сочетание клавиш «Win + S» и введите «cptools» или «Инструменты КриптоПро»
Наберите в меню пуск или в поиске 
«cptools»
Запустите программу: Finder > Программы > Инструменты КриптоПро
или воспользуйтесь поиском через сочетание клавиш «Command ⌘ — пробел» и введите «cptools» или «Инструменты КриптоПро»
Установка сертификата в контейнер
Откройте вкладку «Сертификаты», затем нажмите кнопку «Установить сертификаты» и выберите файл сертификата (обычно с расширением .cer или .crt)
После успешной установки появится сообщение «Установка завершена, сертификаты распределены по хранилищам»
Проверьте работу электронной подписи на тестовой странице.